Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP8Q96LD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP8Q96LD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms