Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM47Q96LD4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms