Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MS4A4AQ96JQ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MS4A4AQ96JQ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms