Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCHS1Q96JQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms