Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms