Protein–RNA interactions for Protein: Q96IZ5

RBM41, RNA-binding protein 41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM41Q96IZ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM41Q96IZ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM41Q96IZ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms