Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD1Q96GM5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms