Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms