Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35C1Q96A29 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35C1Q96A29 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms