Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP4Q969X6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms