Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP13Q92995 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP13Q92995 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP13Q92995 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP13Q92995 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP13Q92995 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP13Q92995 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP13Q92995 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP13Q92995 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP13Q92995 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP13Q92995 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP13Q92995 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP13Q92995 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP13Q92995 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP13Q92995 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP13Q92995 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP13Q92995 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP13Q92995 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP13Q92995 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP13Q92995 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP13Q92995 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP13Q92995 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP13Q92995 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms