Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB1CQ92928 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB1CQ92928 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms