Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCC1Q92922 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCC1Q92922 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCC1Q92922 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCC1Q92922 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCC1Q92922 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCC1Q92922 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms