Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PROX1Q92786 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PROX1Q92786 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms