Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT35Q92764 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT35Q92764 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms