Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF3Q92576 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF3Q92576 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms