Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM3CQ92520 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms