Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4AQ8WYN0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4AQ8WYN0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms