Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L4Q8WXT5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L4Q8WXT5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L4Q8WXT5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L4Q8WXT5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L4Q8WXT5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms