Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C7orf43Q8WVR3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms