Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF4Q8WV16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF4Q8WV16 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms