Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX29Q8TEQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms