Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC44■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC43.99■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RB1CC1Q8TDY2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
RB1CC1Q8TDY2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms