Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX54Q8TDD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms