Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD1Q8NHV4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms