Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms