Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TC2NQ8N9U0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TC2NQ8N9U0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TC2NQ8N9U0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms