Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC24Q8N4L8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC24Q8N4L8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms