Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP4X1Q8N118 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms