Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3FQ8IUX4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3FQ8IUX4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms