Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms