Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNKQ7Z7G1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms