Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG9AQ7Z3C6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms