Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms