Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
UBR3Q6ZT12 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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