Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms