Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms