Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYHR1Q6ZMK1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms