Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KSR2Q6VAB6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KSR2Q6VAB6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms