Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms