Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms