Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF2Q6PJF5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHBDF2Q6PJF5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms