Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE2Q6PIF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms