Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8BQ6P9F7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms