Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LLGL2Q6P1M3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LLGL2Q6P1M3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LLGL2Q6P1M3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms