Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54Q6NXT1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms