Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGMBQ6NW40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms