Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms