Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF6Q6KF10 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms