Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPPQ6IPU0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 455.7 ms