Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX8Q68G74 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms